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Impact du microbiome sur l’allergie digestive

microbiome l’allergie
En face de l’augmentation constante des allergies dans les pays occidentaux l’hypothèse que l’altération du microbiote intestinal serait en cause est de plus en plus retenue par les chercheurs. L’observation d’un microbiote fécal altéré entre nourrisson allergique et non allergique a été constatée, mais est-ce la cause ou la conséquence de la maladie ?
Concernant l’origine de cette dysbiose, plusieurs hypothèses sont avancées: des facteurs génétiques, le mode de vie aseptisé empêchant le système immunitaire de se développer, l’utilisation des antibiotiques chez la femme enceinte et le nourrisson, l’alimentation….  

Dans ce contexte,  deux équipes américaines de Philadelphie, celle d’A.B. Muir et coll.* de Pennsylvanie et celle d’A. Fillon et coll. de Denver, ont étudié le microbiome et son impact sur l’atopie gastro-intestinale et plus spécifiquement dans l’oesophagite à éosinophile (OE)

Si longtemps l’oesophage a été considéré dépourvu de bactéries, actuellement il en est  dénombré à peu près 300 espèces. A l’hôpital des Enfants, à Philadelphie, des chercheurs ont observé les différences entre le microbiote de la cavité buccale et de l’oesophage chez 33 enfants porteurs d’une OE par rapport à 35 sujets sains ; ces derniers sont porteurs de Streptococcus et d’Atopobium majoritairement alors que dans les cas d’OE ce sont les souches Neisseria et Corynebacterium (cf tableau) ; ils ont noté, également que les changements de régime alimentaire modifiaient le microbiote fécal,  et le microbiote de l’oesophage. Du coup des explorations sont en cours pour savoir si certaines bactéries ne pourraient pas être utilisées afin d’améliorer l’inflammation de l’œsophage.

D’autres études sont nécessaires pour établir, chez les personnes atopiques avec manifestations comme l’asthme, la dermatite atopique et les maladies à éosinophiles du tube digestif, si leur microbiote gastro- intestinal détient bactéries semblables similaires permettant de caractériser la maladie allergique. Ce microbiote pourrait alors être modifié pour s’approcher d’un microbien physiologiquement normal.

Tous ces résultats doivent être corroborés par des équipes d’autres pays afin de mieux connaître la composition et le rôle du microbiote intestinal dans les phénomènes d’allergie.

 

Le microbiote lié à l’intestine atopique chez l’homme (d’après A. B. Muir et coll.)
 
Maladies Microbiotes Devenir du microbiote Site Auteurs
Intolérance aux protéines du lait de vache (APLV) Lachnospiraceae et Ruminococcaceae Augmentation Fécal Berni Canani et coll.
Allergies alimentaires (AA) Clostridium I et Anaerobacter Augmentation  Fécal Ling et coll.
  Bacteroides et Clostridium XVIII Diminution Fécal Ling et coll.
  Sphingomonas, Sutterella, Bifidobacterium, Collinsella, Clostridium sensu stricto, Clostridium IV, Enterococcus, Lactobacillus, Roseburia, Faecalibacterium, Ruminococcus, Subdoligranulum et Akkermansia Augmentation Fécal Chen et coll.
  Bacteroides, Parabacteroides, Prevotella, Alistipes, Streptococcus et Veillonella Diminution Fécal Chen et coll.
Œsophagite à éosinophiles (OE) Prevotella, Streptococcus et Neisseria Données partagées  Oral et œsophagien Benitez et coll.
  Neisseria et Corynebacterium Augmentation dans les formes actives Œsophagien Benitez et coll.
  Granulicatella et Campylobacter Augmentation lors de la réintroduction d’aliments hautement allergisants Œsophagien Benitez et coll.
  Proteobacteria (Haemophilus)  Plus abondants dans les formes non traitées Œsophagien Harris et coll. 
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